Mauro E. Berta R.
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(corte y empalme alternativo)
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Características
DNA lineal, doble hebra.
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Características
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Cromosomas
DNA Histonas
Bases
Azúcar Nucleosoma
Grupo fosfato
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Bases púricas y pirimídicas:

Púricas: Adenina y guanina
Pirimídicas: Citosina, timina y uracilo.
SECUENCIA DE NUCLEÓTIDOS
Nucleótido: Nucleósido + Fosfato
Nucleósido: Azúcar + base.
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Las secuencias del DNA se clasifican:
* Altamente repetitivas.
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Transcripción
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1. Está constituido por codones, que son tripletes
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CARACTERÍSTICAS
5. Existen codones de terminación
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Para codificar los 20 aminoácidos se necesita que
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LOS TRIPLETES NO SE SOLAPAN
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DEGENERACIÓN
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MUTACIÓN
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Algunos polimorfismos sanguíneos
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Algunos polimorfismos sanguíneos
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Algunos polimorfismos de determinación directa
GEN ALELOS
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Pueden estar presentes en regiones codificantes
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MICROSATÉLITES
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Extensión de oligonucleótidos
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CARIOTIPO
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La mayoría son casos esporádicos.
CARIOTIPO
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Usualmente de novo
Pueden existir...
El metabolismo del alcohol se lleva a cabo en dos fases:
Alcohol
...
Estas enzimas, exhiben polimorfismos

genéticos con variaciones según el grupo
étnico
Existen formas múltip...
La clase I contiene los siguientes genes:

ADH1, ADH2 y ADH3
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CYP2E1 es un gen de 14 Kb que muestra

diversos polimorfismos genéticos
Alelos:
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Polimorfismos Geneticos
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Polimorfismos Geneticos

Published on: Mar 4, 2016
Source: www.slideshare.net


Transcripts - Polimorfismos Geneticos

  • 1. Mauro E. Berta R.
  • 2. Características que se transmiten.  Permiten mantener la especie  Unidad hereditaria: GEN  GEN Molécula de DNA  Genotipo: carga genética individual 
  • 3. GEN Definiciones Unidad elemental o básica de la herencia  Región física y funcional que controla una  característica hereditaria concreta
  • 4. GEN Definiciones Molecular: Conjunto de secuencias de DNA de  todo tipo, estructurales (intrones y exones) y reguladoras necesarias para codificar un producto génico, sea éste un RNA maduro o una proteína funcional.
  • 5. Genoma humano: 30 000 a 35 000 genes. (corte y empalme alternativo)
  • 6. A-DNA : Poca humedad y alta concentración  de sales. Gira a la derecha. B-DNA : Mucha humedad y baja  concentración de sales. Gira a la derecha. Z-DNA : Gira a la izquierda  Han sido descritas 11 distintas conformaciones. 
  • 7. Características DNA lineal, doble hebra.  6,600 000 Kb = 6,600 Mb = 6.6 X 10⁹ pb.  Proteínas asociadas: histonas y no histonas.  1 gen cada 33-50 Kb  Longitudinalmente el DNA de una célula sería  2 m.
  • 8. Características Presencia de intrones (secuencias no  codificantes). Presencia de exones (secuencias codificantes).  DNA codificante 3 a 5%  DNA repetitivo 30% 
  • 9. Cromosomas DNA Histonas Bases Azúcar Nucleosoma Grupo fosfato
  • 10. DNA Bases púricas y pirimídicas:  Púricas: Adenina y guanina Pirimídicas: Citosina, timina y uracilo.
  • 11. SECUENCIA DE NUCLEÓTIDOS Nucleótido: Nucleósido + Fosfato Nucleósido: Azúcar + base.
  • 12. HISTONAS Proteínas básicas a las que se enrolla el DNA: H2A,H2B,H3,H4 H1 Formando unidades de octámeros que se conocen como nucleosomas
  • 13. Los nucleosomas consisten en 146 pb. aproximadamente La histona H1 sella a los nucleosomas y permite que se unan con otros. El nucleosoma más la H1 y las bases que une se conocen como cromatosoma y consta de 166 pb aproximadamente
  • 14. Las secuencias del DNA se clasifican: * Altamente repetitivas. * Moderadamente repetitivas. * Secuencia o copia única.
  • 15. Las secuencias de copia única son las que codifican la mayoría de los RNA. Aproximadamente 3 a 5% del genoma es codificante.
  • 16. INDIVIDUALIDAD GENÉTICA:  Nos permite diferenciarnos unos de otros. Nuestros genes se expresan de forma diferente en cada uno: Normal o Anormal.
  • 17. Segregación.  Recombinación independiente.  Meiosis : Entrecruzamiento 
  • 18. ⇨ Características que se manifiestan. ⇨ Es variable. Puede haber mayor o menor expresividad. ⇨ Fenotipo. Son las características del genotipo que se expresan. ⇨ Genotipo: Carga hereditaria.
  • 19. Número cromosómico: 46 Empaquetamiento: Nucleosoma Solenoide Asas Cromosomas
  • 20. Una función primordial de los genes es la síntesis de proteínas: ⇨ Transcripción: DNA RNA ⇨ Traducción: RNA Proteína
  • 21. El código genético es el conjunto de pautas que rigen la transferencia de la información contenida en el RNAm (y por lo tanto en el DNA), para la síntesis de proteínas.
  • 22. Establece la correspondencia entre los 64 posibles tripletes de bases del RNAm y los 20 aminoácidos de las proteínas.
  • 23. La molécula de ADN, tiene la estructura de una escalera formada  por azúcares, fosfatos y cuatro bases nucleotídicas llamadas: uracilo o timina (U o T), adenina (A), guanina (G) y citosina (C). El código genético queda determinado por el orden de estas bases, y cada gen tiene una secuencia única de pares de bases.
  • 24. Asocia a cada triplete de bases del ADN, un aminoácido concreto  A un triplete se lo conoce con el nombre de CODÓN  Se pueden formar 64 codones  Cada codón se atribuye a uno de los 20 aminoácidos posibles   Entonces hay algunos aminoácidos designados por varios codones Las dos primeras letras del codón son las dominantes  La tercera letra puede:   Ser un complemento indiferente (sólo está para que se cumpla el código de tres letras)  Designar a otro aminoácido de una familia próxima No todos los codones codifican a un aminoácido  Hay 3 (UAG, UAA y UGA) que señalan el final de la parte  codificadora  Cuando el proceso “lee” alguno de ellos, se interrumpe la síntesis proteica
  • 25. Por ejemplo, la G en las filas de la „primera letra‟, la C bajo las  columnas de la „segunda letra‟ y la A en las filas de la „tercera letra‟ se cruzan en la alanina, el aminoácido especificado por la secuencia GCA
  • 26. Código Genético Separación de cadenas del ADN Eliminación de Intrones Transcripción
  • 27. ARNm se une al Ribosoma ARNt se une a Aminoácidos Traducción Interrupción de Síntesis Polipeptídica
  • 28. Formación completa de la Proteína
  • 29. CARACTERÍSTICAS 1. Está constituido por codones, que son tripletes (3 nucleótidos-bases). 2. Los tripletes no se solapan. 3. Existen 3 marcos de lectura. 4. Existe un codón de inicio
  • 30. CARACTERÍSTICAS 5. Existen codones de terminación 6. Es degenerado.
  • 31. CODÓN Para codificar los 20 aminoácidos se necesita que cada uno esté especificado por una secuencia de tres nucleótidos, llamada Triplete o codón
  • 32. LOS TRIPLETES NO SE SOLAPAN Es decir que aunque sean contiguos no comparten nucleótidos. La secuencia del primer nucleótido NO restringe las posibilidades del segundo, ni éste del tercero y así sucesivamente.
  • 33. MARCOS DE LECTURA Los codones no presentan separación entre ellos, por lo que sería factible iniciar la lectura del RNAm en cualquiera de los tres nucléotidos del primer codón. Esto se conoce como marcos de lectura y existen tres.
  • 34. TRES MARCOS DE LECTURA ABC, DEF, GHI, JKL,…. 1 BCD, EFG, HIJ, KLM,… 2 CDE, FGH, IJK, LMN,… 3 El cuarto ya coincide con el primero, sólo que con un aminoácido menos.
  • 35. CODÓN DE INICIO En la mayoría de los casos, el codón de inicio es AUG, que también codifica para metionina. Esta secuencia para actuar como codón de inicio debe formar parte de la secuencia de Kozak (purina a -3 y guanina a +4).
  • 36. CODONES DE TERMINACIÓN Existen 3 codones que no codifican para aminoácido alguno, son UAA, UAG Y UGA, son lo que determinan la finalización de la síntesis proteica. Se denomina codones de terminación, de paro o sin sentido.
  • 37. DEGENERACIÓN Esta característica se refiere al hecho de que un aminoácido esté codificado por más de un codón. Los codones que codifican para el mismo aminoácido se denominan sinónimos.
  • 38. DEGENERACIÓN Esta característica confiere protección, ya que disminuye la posibilidad de que las mutaciones puntuales provoquen la incorporación a la proteína de un aminoácido distinto.
  • 39. LOS CROMOSOMAS QUE FORMAN UN PAR SE DENOMINAN HOMÓLOGOS. EL PAR DE GENES HOMÓLOGOS SE DENOMINA ALELOS.
  • 40. Cuando ambos alelos son iguales es homocigosis. Cuando son diferentes es heterocigosis
  • 41. 48
  • 42. 49
  • 43. 50
  • 44. 51
  • 45. 52
  • 46. 53
  • 47. CARIOTIPO HUMANO ¿………………..? 54
  • 48. GENOMA HUMANO Genoma nuclear Genoma mitocondrial 3 300 Mb 16.6 Kb 35 000 genes 37 genes 25% 75% 2 genes 22 genes 13 genes RNAr RNAt Polipéptidos genes y DNA secuencias extragénico relacionadas Único o 60 % copia única 40 % moderada- mod. repetitivo o bajo # copias altamente repetitivo 10% 90% DNA DNA repetidos en repetidos codificante no codificante tándem dispersos DNA satélite LINES DNA mini satélite SINES pseudogenes fragmentos intrones, DNA microsatélite LTRs génicos secuencias no traducidas Transposones
  • 49. P roducto génico T am año del gen N úm ero de T am año prom edio T am año prom edio (kb) exones del exón (bp) del intrón (bp) R N A t tyr 0.1 2 50 20 Insulina 1.4 3 155 480 1.6 3 150 490 globina H LA clase I 3.5 8 187 260 A lbúm ina sérica 18 14 137 1 100 C olágena tipo V II 31 118 77 190 C om plem ento C 3 41 29 122 900 Fenilalanina 90 26 96 3 500 hidroxilasa Factor V III 186 26 375 7 100 coagulación C FT R (fibrosis 250 27 227 9 100 quística D istrofina 2400 79 180 30 000
  • 50. -El locus se refiere a la posición o localización  de un gen en el genoma.  Los locus genéticos se definen por la  localización cromosómica, utilizando las bandas  de los cromosomas (banda G o banda R) o  marcadores moleculares (microsatelites) como  punto de referencia.  Ejemplo: Gen de determinación del sexo  (SRY) se localiza en el sitio p 11 del  cromosoma Y. 
  • 51. - Un alelo es la “versión” de un gen  que está presente en un locus dado.  Estas diferencias alélicas se  relacionan con las alteraciones en la  secuencia de nucleótidos de un gen. 
  • 52. En sentido estricto:  El polimorfismo se refiere a la ocurrencia de  alelos multiples en un locus, donde al menos dos alelos aparecen  con una frecuencia >1% en la población general.  POLIMORFISMO: Una serie de fenotipos  alternativos normales y comunes
  • 53. Frecuencias alélicas y haplotípicas Diferentes alelos en un gen
  • 54. - La mayoría de los polimorfismos no tienen  efecto sobre el fenotipo (caen en regiones no codificantes).  - Algunos pocos afectan nuestro fenotipo  (Estatura: alta/baja; Cabello: claro/oscuro;  Color de ojos) - Un numero muy pequeño de polimorfismos  son responsables de enfermedades genéticas 
  • 55. MUTACIONES Y POLIMORFISMOS Secuencia normal D Mutación de sentido equivocado no conservativa A 5’.… ATG TCT CAA AAA TTT ACG CGT .…3’ 5’.… ATG TCT CAA GAA TTT ACG CGT .…3’ 3’…. TAC AGA GTT TTT AAA TGC GCA ….5’ 3’…. TAC AGA GTT CTT AAA TGC GCA ….5’ met ser gln lys phe thr arg met ser gln glu phe thr arg Mutación silenciosa o sinónima Mutación sin sentido B E 5’.… ATG TCT CAA AAG TTT ACG CGT .…3’ 5’.… ATG TCT CAA TAA TTT ACG CGT .…3’ 3’…. TAC AGA GTT TTC AAA TGC GCA ….5’ 3’…. TAC AGA GTT ATT AAA TGC GCA ….5’ met ser gln alto met ser gln lys phe thr arg Mutación por cambio en el marco de lectura C Mutación de sentido equivocado conservativa o neutra F 5’.… ATG TCT CAA AGA TTT ACG CGT .…3’ 5’.… ATG TCT CAA GAA ATT TAC GCG .…3’ 3’…. TAC AGA GTT TCT AAA TGC GCA ….5’ 3’…. TAC AGA GTT CTT TAA ATG CGC ….5’ met ser gln arg phe thr arg met ser gln glu ile tyr ala
  • 56. MUTACIÓN
  • 57. Frecuencias alélicas y haplotípicas Diferentes haplotipos para un grupo de marcadores SNP
  • 58. Algunos polimorfismos sanguíneos GEN UBICACIÓN ALELOS POLIMÓRFICOS Antígenos eritrocitarios ABO 9q34.1-34.2 ABO*A1,ABO*A2,ABO*B,ABO*0 Diego DI*A,DI*B Duffy 1q21-25 FY*A,FY*B,FY Kell K,k Kidd 18q11-12 JK*A,JK*B Lewis 19 LE*LE,LE*Le Lutheran 19q12-13 LU*A,LU*B MNSs (2) 4q28-31 MNS*MS,MNS*Ms,MNS*NS,MNS*Ns P 22q11.2-qter P1*1,P1*2,P1*p Rh (3) 1p36.2-34 CDE,CDe,CdE,Cde,cDE,cDe,cdE,cde Secretor FUT2(SE)*Se,FUT2(SE) *se Proteínas plasmáticas  1-antitripsina lfa 14q32.1 PI*M1,PI*M2,PI*M3,PIS,PIZ Ceruloplasmina 3q23-25 CP*B,CP*A,CP*C Componente de complemento 3 19p13.3-13.2 C3*S,C3*F Componente específico de grupo 4q12-13 GC*1F,GC*1S,GC*2 Haptoglobina 16q22.1 HP*1S,HP*1F,HP*2
  • 59. Algunos polimorfismos sanguíneos GEN UBICACIÓN ALELOS POLIMÓRFICOS Inmunoglobulinas GM (3) 14q32.33 GM*1,17 23' 21,28 GM*1,17 23 21,28 GM*1,2,17 23' 21,28 GM*1,2,17 23 21,28 GM*1,3,17 23' 5*,21,28 GM*1,3,17 23 5*,21,28 GM*1,2,3,17 23' 5*,21,28 GM*1,2,3,17 23 5*,21,28 GM*1,3,17 23' 5* GM*1,3,17 23 5* GM*3 23' 5* GM*3 23 5* Transferrina 3q21 TF*C1,TF*C2,TF*C3,TF*,TF*D Enzimas eritrocitarias Adenilato kinasa 1 9q34.1-34.2 AK1*1,AK1*2 Adenosín deaminasa 20q13.11 ADA*1,ADA*2 Esterasa D 13q14.1-14.2 ESD*1,ESD*2 Fosfatasa ácida 1 2p25 ACP1*A,ACP1*B,ACP1*C Fosfoglucomutasa 1 1p22.1 PGM1*1,PGM1*2,PGM1*3,PGM1*4 Peptidasa A 18q23 PEPA*1,PEPA*2 Antígenos leucocitarios HLA-A 6p21.3 A1,A2,A3,A11,A23,A24,A25,A26,A28,A29,A30,A31, A32,A33,A34,A36,A43 HLA-B 6p21.3 B7,B8,B13,B14,B18,B27,B35,B37,B38,B39,B41,B42, B44,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B54, B55,B56, B57,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B67,B70,B73,B75 HLA-C 6p21.3 Cw1,Cw2,Cw4,Cw5, Cw6,Cw7,Cw9,Cw10
  • 60. Algunos polimorfismos de determinación directa GEN ALELOS Microsatélites D3S1358 11, 11.2, 12, 13, 14, 15, 16, 16.2, 17, 18, 19, 20 D5S818 7, 8, 9, 9,2, 10, 11, 12, 13, 14, 15 D7S820 6, 7, 8, 9, 9,1, 9,3, 10, 11, 12, 12,2, 13, 14, 15 D8S1179 7, 8, 9, 10, 11, 11,3, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18 D13S317 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16 D18S51 8, 9, 10, 11, 12, 13, 13.2, 14, 14.2, 15, 15.2, 16, 17, 17.2, 18, 19, 20, 20.2, 21, 22, 23, 24 D21S11 24.2, 25, 25.2, 26, 26.2, 27, 28, 28.2, 29, 29.2, 30, 30.2, 31, 31.2, 32, 32.2, 33, 33.2, 34, 34.2, 35, 35.2, 36, 38 FGA (FIBRA) 17, 18, 18.2, 19, 19.2, 20, 20.2, 21, 21.2, 21.3, 22, 22.2, 22.3, 23, 23.2, 23.3, 24, 24.2, 25, 25.1, 25.2, 26, 26.5, 27, 27.2, 28, 29, 30, 30.2 VWA31 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21 CSF1PO 6, 7, 8, 9, 9.1, 10, 10.3, 11, 12, 13, 14, 15, 16 D16S539 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 TH01 5, 6, 7, 8, 8.3, 9, 9.3, 10, 11 TPOX 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 Minisatélites APOB 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58 D1S80 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41 D17S5 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14
  • 61. Algunos polimorfismos de determinación directa GEN ALELOS Inserciones Alu ACE Inserción, No inserción TPA25 Inserción, No inserción PV92 Inserción, No inserción APO Inserción, No inserción D1 Inserción, No inserción FXIIIB Inserción, No inserción B65 Inserción, No inserción A25 Inserción, No inserción Genes HLA DRB1 DRB1*0101, DRB1*0102, DRB1*0103, DRB1*0104, DRB1*1501, DRB1*1502, DRB1*1503, DRB1*1601, DRB1*1602, DRB1*1603, DRB1*1605, DRB1*0301, DRB1*03011, DRB1*0302, DRB1*0304, DRB1*0401, DRB1*0402, DRB1*0403, DRB1*0404, DRB1*0405, DRB1*0406, DRB1*0407, DRB1*0408, DRB1*0410, DRB1*0413, DRB1*1101, DRB1*1102, DRB1*1103, DRB1*1104, DRB1*1106, DRB1*1109, DRB1*1111, DRB1*1112, DRB1*1127, DRB1*1201, DRB1*1202, DRB1*1301, DRB1*1302, DRB1*1303, DRB1*1305, DRB1*1306, DRB1*1307, DRB1*1308, DRB1*1315, DRB1*1401, DRB1*1402, DRB1*1404, DRB1*1405, DRB1*1406, DRB1*1407, DRB1*1408, DRB1*1409, DRB1*1410, DRB1*0701, DRB1*0801, DRB1*0802, DRB1*0803, DRB1*08032, DRB1*0804, DRB1*0805, DRB1*0806, DRB1*0811, DRB1*0901, DRB1*09012, DRB1*1001 DQB1 DQB1*0501, DQB1*0502, DQB1*05031, DQB1*0503, DQB1*06011, DQB1*0601, DQB1*0602, DQB1*0603, DQB1*0604, DQB1*0605, DQB1*0607, DQB1*0609, DQB1*0201, DQB1*0202, DQB1*0301, DQB1*0302, DQB1*03032, DQB1*0303, DQB1*0304, DQB1*0305, DQB1*0401, DQB1*0402
  • 62. FARMACOGENÓMICA POLIMORFISMOS GENÉTICOS EN ENZIMAS METABOLIZADORAS DE DROGAS (DME)
  • 63. La gran mayoría de los SNP‟s tienen dos alelos  los cuales están representados por una sustitución de base por otra. En las poblaciones, este tipo de alelos se  clasifican en alelo principal o “silvestre” y alelo raro o mutante uno cada 200 pares de bases
  • 64. Pueden estar presentes en regiones codificantes  y provocar un cambio en un aminoácido; Se les conoce como “no sinónimos”. Pueden presentarse en la región promotora del  gen, influenciando la actividad transcripcional del gen (modulando la unión de factores de transcripción), en intrones (modulando la estabilidad de la proteína), en sitios de “splicing” (sitios donde ocurre la eliminación de intrones y unión de exones) o en regiones intragénicas.
  • 65. Un nivel adicional de variabilidad genética lo  constituyen los haplotipos, los cuales están compuestos por un conjunto de SNP‟s a lo largo de un mismo cromosoma que son heredados como una unidad. La diferencia fundamental entre un haplotipo y los SNP‟s individuales, es que los alelos en los haplotipos son asignados a un cromosoma.
  • 66. VNTRminisatélites  VNTR-microsatélites o STR  En ambos casos presentan un número variable  de repeticiones en tándem.
  • 67. Los minisatélites son loci que corresponden a  secuencias de ADN de unas pocas decenas de nucleótidos repetidas en tándem. El número de dichas repeticiones varía cada loci puede presentar muchos alelos distintos (tantos como repeticiones), sin embargo, presentan el inconveniente de que no están distribuidos por todo el genoma y sólo pueden ser utilizados en el diagnóstico de un número muy reducido de enfermedades. Determinación de la paternidad y protocolos de  identificación genética en el ámbito judicial. Cuando se habla de huellas dactilares del ADN se está hablando de este tipo de polimorfismo.
  • 68. Los VNTR-microsatélites son por excelencia los  polimorfismos anónimos utilizados en el diagnóstico genético. Corresponden a la repetición en tándem de secuencias de entre 2 y 5 nucleótidos. están distribuidos de forma casi homogénea por todo el genoma y presentan un número elevado de alelos con frecuencias similares entre sí, de forma que la probabilidad de que un individuo sea heterocigoto es muy elevada (presentan una alta heterocigosis).
  • 69. T ip o Tam año del Lo ca liza ció n cro m o só m ica re p e tid o D N A m e g a s a té lite (b lo q u es d e cien to s k b ) A lg u n as k b V ario s sitio s cro m o so m as esp ecífico s R S 447 4.7 k b ~ 50 -70 co p ias en 4p 15 y alg u n as en 8p S in n o m b re 2.5 k b ~ 400 co p ias en 4q 31 y 19q 13 S in n o n b re 3.0 k b ~ 50 co p ias en cro m o so m a D N A s a té lite (b lo q u es d e 100 k b a M b ) 5 -171 p b E sp ecialm en te en cen tró m ero s (D N A alfo id e) 171 p b H etero cro m atin a cen tro m érica to d o s cro m o so m as (fam ilia S au 3 A ) 68 p b H etero cro m atin a cen tro m érica d el 1, 9, 13 14, 15, 21, S atélite 1 ( rico en A -T ) 2 5-48 p b 22 y Y 5 pb R eg io n es h etero cro m áticas d e m ay o ría d e cro m o so m as S atélites 2 y 3 L a m ay o ría o p o sib lem en te to d o s lo s cro m o so m as D N A m in is a té lite (b lo q u es d e 0.1 – 20 k b ) 6 -64 p b E n o cerca d e to d o s lo s teló m ero s F am ilia telo m érica 6 pb T o d o s lo s teló m ero s F am ilia h ip erv ariab le 9 – 64 p b T o d o s lo s cro m o so m as, cerca d e lo s teló m ero s D N A m icro s a té lite (b lo q u es d e m en o s d e 1 – 4 pb D isp erso p o r to d o s lo s cro m o so m as 150 p b
  • 70. MICROSATÉLITES
  • 71. El estudio de los polimorfismos tiene muchas  aplicaciones en medicina, investigaciones biológicas y procesos jurídicos. Los polimorfismos localizados cerca de un “gen candidato” pueden ser usados para hallar el gen por sí mismo a través de un mapeo genético. En este proceso el investigador está en búsqueda de polimorfismos que son heredados junto con la enfermedad, tratando de delimitar estos polimorfismos en regiones más y más pequeñas del cromosoma. Así, la región del cromosoma implicada en la enfermedad puede ser progresivamente delimitada, y el gen responsable finalmente puede ser localizado.
  • 72. En un estudio de prueba directa, el supuesto SNP  responsable de una enfermedad es genotipificado directamente. El reto de este tipo de estudios es predecir o determinar a priori cuáles SNP‟s son los responsables del fenotipo de interés. Los estudios indirectos de asociación genética se  basan en un análisis de ligamiento genético el cual utiliza “marcadores neutrales”, y no hace predicciones sobre la localización del gen responsable de la enfermedad en estudio. Los estudios de asociación indirecta son más frecuentes en estudios de casos-control.
  • 73. A partir de las pruebas indirectas existen dos  estrategias que han sido utilizadas para identificar los genes y los polimorfismos que están implicados con el desarrollo de ciertas enfermedades: el análisis de ligamiento y estudios de asociación de genes candidatos. El análisis de ligamiento requiere el reclutamiento de familias afectadas, mientras que el estudio de genes candidatos es probado por estudios de asociación de sujetos no relacionados.
  • 74. El análisis de ligamiento o escaneo genómico es un  método en el cual se hace una búsqueda aleatoria en el genoma para tratar de encontrar los genes asociados a una enfermedad. Requiere cuando menos dos generaciones de las familias afectadas. En los estudios de asociación genética se buscan  polimorfismos individuales de genes implicados en la patogénesis de la enfermedad y, así, determinar si existe algún tipo de relación con ella, para lo que primero se deben identificar genes candidatos que se crea o se sepa son importantes en la patogénesis de una condición.
  • 75. Geles de electroforesis en gradiente  desnaturalizante/térmico Polimorfismo de conformaciones de cadena  sencilla Cromatografía líquida de alta resolución  Secuenciación por hibridación 
  • 76. Hibridación  Extensión de oligonucleótidos  PCR en tiempo real 
  • 77. CARIOTIPO 4p- (4p16). Anillos y mosaico son raros. La mayoría son casos esporádicos.
  • 78. CARIOTIPO 5p- Deleción 5 p (5p14p15), pueden encontrarse involucrados otros segmentos. Usualmente de novo Pueden existir casos de mosaicos, translocaciones y anillos. Se observan menos frecuentemente.
  • 79. El metabolismo del alcohol se lleva a cabo en dos fases: Alcohol Alcohol deshidrogenasa CYP450 E2 Acetaldehído Acetaldehído deshidrogenasa Acetato
  • 80. Estas enzimas, exhiben polimorfismos  genéticos con variaciones según el grupo étnico Existen formas múltiples de ADH en el  hígado humano. Hasta el momento se conocen 7 genes
  • 81. La clase I contiene los siguientes genes:  ADH1, ADH2 y ADH3 Alelos para ADH2 son:  ADH2*1 y ADH2*2 La clase II contiene el gen ALDH2, se  localiza en la mitocondria Alelos:  ALDH2*1 y ALDH2*2
  • 82. CYP2E1 es un gen de 14 Kb que muestra  diversos polimorfismos genéticos Alelos:  región reguladora 5’ c1 c2 intrón 6 C D intrón 7 A1 A2 Es inducido por el consumo crónico del  alcohol

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